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对衣原体感染，防治是关键。衣原体对热较敏感，56～60℃时(也就是手放在水里感到烫手的程度时)仅能存活5～10分钟。将污染的毛巾、盆具等干燥1小时后，用75%的酒精和5%的肥皂液，均可以杀灭衣原体。如果夫妻一方感染了衣原体，另一方应同时检查与治疗。最好在医生的指导下用药。一般采用中西医结合的方法治疗，才能治彻底。

感染了衣原体会患哪些疾病呢？调查发现，患盆腔炎的妇女，有一半是由衣原体感染引起的，而患有不孕症的妇女中有44.2%可检查到衣原体抗体，它是导致不孕的重要原因。此外，衣原体还会引起妊娠妇女流产、早产、死胎，以及肺炎、非淋菌性尿道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、输卵管炎以及盆腔炎、直肠炎等等。它亦可以通过性接触进行传播，感染男性的尿道，引发特发性附睾炎、前列腺炎、直肠炎、导致男性不育等。衣原体感染约有70%的患者无明显的症状，有些患者临床表现较轻。所以当女性出现白带增多、脓性白带、性交后出血，男性有尿道刺激症状时，要及时去医院诊治。